Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TSR2Q969E8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSR2Q969E8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSR2Q969E8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSR2Q969E8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSR2Q969E8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSR2Q969E8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSR2Q969E8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSR2Q969E8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSR2Q969E8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSR2Q969E8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSR2Q969E8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSR2Q969E8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSR2Q969E8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSR2Q969E8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSR2Q969E8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSR2Q969E8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSR2Q969E8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSR2Q969E8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSR2Q969E8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSR2Q969E8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TSR2Q969E8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSR2Q969E8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSR2Q969E8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSR2Q969E8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSR2Q969E8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSR2Q969E8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSR2Q969E8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSR2Q969E8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSR2Q969E8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSR2Q969E8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSR2Q969E8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSR2Q969E8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSR2Q969E8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSR2Q969E8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSR2Q969E8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSR2Q969E8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSR2Q969E8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TSR2Q969E8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms