Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRF1Q92994 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms