Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF3Q92576 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF3Q92576 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms