Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVR3

C7orf43, Uncharacterized protein C7orf43, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf43Q8WVR3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
C7orf43Q8WVR3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C7orf43Q8WVR3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C7orf43Q8WVR3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C7orf43Q8WVR3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C7orf43Q8WVR3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C7orf43Q8WVR3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C7orf43Q8WVR3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C7orf43Q8WVR3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C7orf43Q8WVR3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C7orf43Q8WVR3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C7orf43Q8WVR3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C7orf43Q8WVR3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C7orf43Q8WVR3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C7orf43Q8WVR3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C7orf43Q8WVR3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C7orf43Q8WVR3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C7orf43Q8WVR3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C7orf43Q8WVR3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
C7orf43Q8WVR3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C7orf43Q8WVR3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
C7orf43Q8WVR3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
C7orf43Q8WVR3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C7orf43Q8WVR3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C7orf43Q8WVR3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C7orf43Q8WVR3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C7orf43Q8WVR3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C7orf43Q8WVR3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C7orf43Q8WVR3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C7orf43Q8WVR3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C7orf43Q8WVR3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C7orf43Q8WVR3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C7orf43Q8WVR3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C7orf43Q8WVR3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C7orf43Q8WVR3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C7orf43Q8WVR3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C7orf43Q8WVR3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
C7orf43Q8WVR3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C7orf43Q8WVR3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C7orf43Q8WVR3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C7orf43Q8WVR3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C7orf43Q8WVR3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C7orf43Q8WVR3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C7orf43Q8WVR3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C7orf43Q8WVR3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
C7orf43Q8WVR3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms