Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

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Length 659 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSH3Q8TE77 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSH3Q8TE77 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
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