Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TTLL11Q8NHH1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTLL11Q8NHH1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms