Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NUP35Q8NFH5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NUP35Q8NFH5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NUP35Q8NFH5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NUP35Q8NFH5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NUP35Q8NFH5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NUP35Q8NFH5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NUP35Q8NFH5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NUP35Q8NFH5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NUP35Q8NFH5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NUP35Q8NFH5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NUP35Q8NFH5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NUP35Q8NFH5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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NUP35Q8NFH5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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NUP35Q8NFH5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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NUP35Q8NFH5 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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NUP35Q8NFH5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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NUP35Q8NFH5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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NUP35Q8NFH5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NUP35Q8NFH5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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