Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00301Q8NCQ3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00301Q8NCQ3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms