Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RDH13Q8NBN7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RDH13Q8NBN7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RDH13Q8NBN7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RDH13Q8NBN7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RDH13Q8NBN7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RDH13Q8NBN7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RDH13Q8NBN7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RDH13Q8NBN7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RDH13Q8NBN7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RDH13Q8NBN7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RDH13Q8NBN7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RDH13Q8NBN7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RDH13Q8NBN7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RDH13Q8NBN7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RDH13Q8NBN7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RDH13Q8NBN7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RDH13Q8NBN7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RDH13Q8NBN7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RDH13Q8NBN7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RDH13Q8NBN7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RDH13Q8NBN7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RDH13Q8NBN7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RDH13Q8NBN7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RDH13Q8NBN7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RDH13Q8NBN7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RDH13Q8NBN7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RDH13Q8NBN7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RDH13Q8NBN7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RDH13Q8NBN7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RDH13Q8NBN7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RDH13Q8NBN7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RDH13Q8NBN7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RDH13Q8NBN7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RDH13Q8NBN7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RDH13Q8NBN7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RDH13Q8NBN7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RDH13Q8NBN7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RDH13Q8NBN7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RDH13Q8NBN7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RDH13Q8NBN7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RDH13Q8NBN7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RDH13Q8NBN7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RDH13Q8NBN7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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RDH13Q8NBN7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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RDH13Q8NBN7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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RDH13Q8NBN7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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RDH13Q8NBN7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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RDH13Q8NBN7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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RDH13Q8NBN7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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RDH13Q8NBN7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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RDH13Q8NBN7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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RDH13Q8NBN7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RDH13Q8NBN7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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