Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FSIP1Q8NA03 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FSIP1Q8NA03 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms