Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC155Q8N6L0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms