Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6K7

SAMD3, Sterile alpha motif domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD3Q8N6K7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD3Q8N6K7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD3Q8N6K7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD3Q8N6K7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD3Q8N6K7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD3Q8N6K7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD3Q8N6K7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD3Q8N6K7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD3Q8N6K7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD3Q8N6K7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD3Q8N6K7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD3Q8N6K7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD3Q8N6K7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD3Q8N6K7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD3Q8N6K7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD3Q8N6K7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD3Q8N6K7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD3Q8N6K7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD3Q8N6K7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD3Q8N6K7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD3Q8N6K7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD3Q8N6K7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD3Q8N6K7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMD3Q8N6K7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMD3Q8N6K7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMD3Q8N6K7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMD3Q8N6K7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMD3Q8N6K7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMD3Q8N6K7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMD3Q8N6K7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMD3Q8N6K7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMD3Q8N6K7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SAMD3Q8N6K7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SAMD3Q8N6K7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SAMD3Q8N6K7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SAMD3Q8N6K7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMD3Q8N6K7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms