Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SKAP1Q86WV1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKAP1Q86WV1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms