Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LCA5Q86VQ0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LCA5Q86VQ0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LCA5Q86VQ0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LCA5Q86VQ0 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LCA5Q86VQ0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LCA5Q86VQ0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LCA5Q86VQ0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LCA5Q86VQ0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LCA5Q86VQ0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms