Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG4DQ86TL0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG4DQ86TL0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms