Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z569

BRAP, BRCA1-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAPQ7Z569 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRAPQ7Z569 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRAPQ7Z569 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRAPQ7Z569 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BRAPQ7Z569 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRAPQ7Z569 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRAPQ7Z569 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRAPQ7Z569 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRAPQ7Z569 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRAPQ7Z569 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRAPQ7Z569 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRAPQ7Z569 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRAPQ7Z569 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BRAPQ7Z569 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRAPQ7Z569 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRAPQ7Z569 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRAPQ7Z569 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRAPQ7Z569 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRAPQ7Z569 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRAPQ7Z569 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRAPQ7Z569 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRAPQ7Z569 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRAPQ7Z569 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
BRAPQ7Z569 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRAPQ7Z569 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms