Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KRT27Q7Z3Y8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KRT27Q7Z3Y8 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
KRT27Q7Z3Y8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT27Q7Z3Y8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms