Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA2D4Q7Z3S7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms