Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG9AQ7Z3C6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG9AQ7Z3C6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms