Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
LRRC9Q6ZRR7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
LRRC9Q6ZRR7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
LRRC9Q6ZRR7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC30.92■■■□□ 2.54
LRRC9Q6ZRR7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
LRRC9Q6ZRR7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
LRRC9Q6ZRR7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
LRRC9Q6ZRR7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
LRRC9Q6ZRR7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
LRRC9Q6ZRR7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
LRRC9Q6ZRR7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
LRRC9Q6ZRR7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
LRRC9Q6ZRR7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
LRRC9Q6ZRR7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
LRRC9Q6ZRR7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
LRRC9Q6ZRR7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC30.91■■■□□ 2.54
LRRC9Q6ZRR7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
LRRC9Q6ZRR7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
LRRC9Q6ZRR7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
LRRC9Q6ZRR7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
LRRC9Q6ZRR7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
LRRC9Q6ZRR7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
LRRC9Q6ZRR7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
LRRC9Q6ZRR7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
LRRC9Q6ZRR7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
LRRC9Q6ZRR7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
LRRC9Q6ZRR7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
LRRC9Q6ZRR7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
LRRC9Q6ZRR7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
LRRC9Q6ZRR7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
LRRC9Q6ZRR7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
LRRC9Q6ZRR7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
LRRC9Q6ZRR7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
LRRC9Q6ZRR7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
LRRC9Q6ZRR7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
LRRC9Q6ZRR7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
LRRC9Q6ZRR7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC30.84■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
LRRC9Q6ZRR7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms