Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFXL1Q6ZNB6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms