Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM72Q6ZMU5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms