Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms