Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TPTE2Q6XPS3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPTE2Q6XPS3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms