Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4T0

C12orf54, Uncharacterized protein C12orf54, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf54Q6X4T0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms