Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4L3Q6VB84 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD4L3Q6VB84 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms