Protein–RNA interactions for Protein: Q6V0L0

CYP26C1, Cytochrome P450 26C1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26C1Q6V0L0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYP26C1Q6V0L0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms