Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC4A10Q6U841 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A10Q6U841 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms