Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP4Q6PIL6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms