Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
APOBEC3HQ6NTF7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
APOBEC3HQ6NTF7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
APOBEC3HQ6NTF7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
APOBEC3HQ6NTF7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
APOBEC3HQ6NTF7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBEC3HQ6NTF7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBEC3HQ6NTF7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBEC3HQ6NTF7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBEC3HQ6NTF7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBEC3HQ6NTF7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APOBEC3HQ6NTF7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms