Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GARNL3Q5VVW2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms