Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU43

PDE4DIP, Myomegalin, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIPQ5VU43 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4DIPQ5VU43 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4DIPQ5VU43 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4DIPQ5VU43 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4DIPQ5VU43 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4DIPQ5VU43 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4DIPQ5VU43 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4DIPQ5VU43 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4DIPQ5VU43 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4DIPQ5VU43 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4DIPQ5VU43 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4DIPQ5VU43 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4DIPQ5VU43 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4DIPQ5VU43 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4DIPQ5VU43 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4DIPQ5VU43 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4DIPQ5VU43 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4DIPQ5VU43 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4DIPQ5VU43 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4DIPQ5VU43 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4DIPQ5VU43 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4DIPQ5VU43 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4DIPQ5VU43 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDE4DIPQ5VU43 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDE4DIPQ5VU43 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDE4DIPQ5VU43 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDE4DIPQ5VU43 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDE4DIPQ5VU43 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDE4DIPQ5VU43 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDE4DIPQ5VU43 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4DIPQ5VU43 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms