Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRPF38BQ5VTL8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRPF38BQ5VTL8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF38BQ5VTL8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF38BQ5VTL8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF38BQ5VTL8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF38BQ5VTL8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF38BQ5VTL8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF38BQ5VTL8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF38BQ5VTL8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF38BQ5VTL8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF38BQ5VTL8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF38BQ5VTL8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF38BQ5VTL8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF38BQ5VTL8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF38BQ5VTL8 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF38BQ5VTL8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF38BQ5VTL8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF38BQ5VTL8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF38BQ5VTL8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF38BQ5VTL8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF38BQ5VTL8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF38BQ5VTL8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF38BQ5VTL8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF38BQ5VTL8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF38BQ5VTL8 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF38BQ5VTL8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF38BQ5VTL8 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF38BQ5VTL8 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms