Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC183Q5T5S1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms