Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARCH8Q5T0T0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms