Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRC9

FAM47A, Protein FAM47A, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47AQ5JRC9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM47AQ5JRC9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM47AQ5JRC9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM47AQ5JRC9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM47AQ5JRC9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM47AQ5JRC9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM47AQ5JRC9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM47AQ5JRC9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM47AQ5JRC9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM47AQ5JRC9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms