Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC4Q5GLZ8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms