Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TDRD12Q587J7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms