Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COBLL1Q53SF7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms