Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV1

NBPF20, Neuroblastoma breakpoint family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF20Q3BBV1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF20Q3BBV1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF20Q3BBV1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF20Q3BBV1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF20Q3BBV1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF20Q3BBV1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF20Q3BBV1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF20Q3BBV1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF20Q3BBV1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF20Q3BBV1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF20Q3BBV1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF20Q3BBV1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF20Q3BBV1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF20Q3BBV1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF20Q3BBV1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF20Q3BBV1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF20Q3BBV1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF20Q3BBV1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF20Q3BBV1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF20Q3BBV1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF20Q3BBV1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF20Q3BBV1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF20Q3BBV1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF20Q3BBV1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF20Q3BBV1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF20Q3BBV1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF20Q3BBV1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF20Q3BBV1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF20Q3BBV1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF20Q3BBV1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF20Q3BBV1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF20Q3BBV1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF20Q3BBV1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBPF20Q3BBV1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms