Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRFIP1Q32MZ4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRFIP1Q32MZ4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms