Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL38Q2WGJ6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms