Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR3

QSER1, Glutamine and serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QSER1Q2KHR3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
QSER1Q2KHR3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
QSER1Q2KHR3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
QSER1Q2KHR3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
QSER1Q2KHR3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
QSER1Q2KHR3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
QSER1Q2KHR3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
QSER1Q2KHR3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
QSER1Q2KHR3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
QSER1Q2KHR3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
QSER1Q2KHR3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
QSER1Q2KHR3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
QSER1Q2KHR3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
QSER1Q2KHR3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
QSER1Q2KHR3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
QSER1Q2KHR3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
QSER1Q2KHR3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
QSER1Q2KHR3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
QSER1Q2KHR3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms