Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SKIDA1Q1XH10 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIDA1Q1XH10 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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