Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
MSMPQ1L6U9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MSMPQ1L6U9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms