Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTN1Q16799 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RTN1Q16799 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
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