Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDUFA9Q16795 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms