Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIK5Q16478 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIK5Q16478 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
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