Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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ZNF56Q15929 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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ZNF56Q15929 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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ZNF56Q15929 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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ZNF56Q15929 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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ZNF56Q15929 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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ZNF56Q15929 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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ZNF56Q15929 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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ZNF56Q15929 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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ZNF56Q15929 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF56Q15929 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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