Protein–RNA interactions for Protein: Q15714

TSC22D1, TSC22 domain family protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC22D1Q15714 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSC22D1Q15714 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSC22D1Q15714 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms